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本周hzangs在最新文獻中選取了11篇分享給大家，第1篇文章介紹細胞外囊泡在肌肉肝臟信號通訊中的功能作用和對減輕脂肪性肝炎的作用；第2篇文章介紹了脂肪炎症細胞外囊泡緩解中年肥胖的機制；第8篇文章進行了大規模無偏差的組學分析，以明確如何篩選腦源性細胞外囊泡的標誌物；第11篇文章重點強調了細胞外囊泡脂質組學分析中需要注意的問題。
1.Remote limb ischemic conditioning alleviates steatohepatitis via extracellular vesicle-mediated muscle-liver crosstalk. 遠程肢體缺血調節通過細胞外囊泡介導的肌肉-肝臟串擾減輕脂肪性肝炎。[Cell Metab] PMID: 40118054摘要：代謝功能障礙相關脂肪性肝炎 (MASH) 是一種具有不良後果的晚期肝病。操縱器官間通訊被認為是管理代謝疾病（包括脂肪性肝炎）的一種有前途的策略。本文中，韦德国际報告了遠程肢體缺血調節 (RIC)，這是一種通過短暫性肌肉缺血保護遠端器官的臨床驗證療法，可顯著緩解不同小鼠模型中的脂肪性肝炎。肢體缺血調節的有益作用是由小細胞外囊泡 (sEVs) 及其攜帶的 microRNA 從肌肉到肝臟的轉移介導的，從而導致肝臟中 miR-181d-5p 升高。肝臟 miR-181d-5p 過表達通過抑制核受體 4A3 (NR4A3) 忠實地反映了肢體缺血調節的分子和組織學益處。此外，接受肢體缺血條件作用的人類志願者體內的循環 EV 改善了原代人類肝細胞和動物模型中的脂肪性肝炎和轉錄組擾動。韦德国际的數據強調了肢體缺血條件作用在脂肪性肝炎治療中的轉化潛力，並擴展了韦德国际對肌肉-肝臟串擾的理解。
2.Adipose progenitor cell-derived extracellular vesicles suppress macrophage M1 program to alleviate midlife obesity. 脂肪祖細胞衍生的細胞外囊泡抑制巨噬細胞 M1 程序以緩解中年肥胖。[Nat Commun] PMID: 40113754摘要：在不同年齡段中，中年人特別容易患肥胖症，全因死亡風險高出 22%。但其潛在機制仍不清楚。在本研究中，韦德国际發現中年受試者白色脂肪組織 (WAT) 中的脂肪祖細胞 (APC) 是導致中年肥胖的潛在原因。具體而言，來自 APC 的細胞外囊泡 (EV) 顯示出減輕中年人脂肪組織巨噬細胞 (ATM) 炎症的能力受損。從機制上講，這些缺乏 miR-145-5p 的 EV 無法抑制 ATM 中 L-選擇素的表達，從而通過NF-κB 信號通路促進其 M1 程序。相反，來自年輕 APC的 EV 可有效抑制 M1 巨噬細胞極化。因此，靶向脂質體被設計用於將 miR-145-5p 類似物遞送至 ATM，從而有效預防中年小鼠的肥胖。總之，韦德国际的研究結果強調了 APC 衍生的 EV 在中年肥胖中的作用，並提出 miR-145-5p 是臨床應用的一個有希望的治療靶點。
3.Circulating Extracellular Vesicles as Putative Mediators of Cardiovascular Disease in Paediatric Chronic Kidney Disease. 循環細胞外囊泡是兒童慢性腎病心血管疾病的假定介質。[J Extracell Vesicles] PMID: 40116365摘要：心血管疾病 (CVD) 是慢性腎病 (CKD) 死亡的主要原因。然而，CKD 中 CVD 的發病機制仍未完全了解。內皮細胞外囊泡 (EC-EVs) 以前與 CVD 有關。韦德国际假設 CKD 會改變 EV 釋放和貨物，從而促進血管重塑。韦德国际招募了 94 名患有 CKD 的兒童，包括腎移植後的患者和健康捐贈者，並在沒有年齡相關合併症的情況下進行了 EV 表型和功能性 EV 分析。血液透析患者的血漿 EC-EVs 增加，腎移植後減少。30 種 microRNA 在總 CKD 血漿EVs 中較少，預計在血管生成和平滑肌細胞增殖中具有重要意義。在體外，CKD 血漿 EVs 誘導血管生成途徑的轉錄組變化，並在 EC 中功能性地損害血管生成特性、遷移和增殖。動靜脈瘺產生的高剪切應力和尿毒症毒素被認為是 EV 釋放的潛在驅動因素，但只有兩者結合才能增加靜脈 EC 中 EV 的生成。由此產生的 EV 重現了CKD 體內觀察到的 miRNA 變化。總之，CKD 會導致釋放具有改變的 miRNA 譜和抗血管生成特性的 EV，這可能會介導 CKD 兒童的血管病理。EV 及其miRNA 載體可能代表減輕 CKD 中 CVD 的未來治療靶點。
4.Diagnostic efficacy of an extracellular vesicle-derived lncRNA-based liquid biopsy signature for the early detection of early-onset gastric cancer. 基於細胞外囊泡衍生的 lncRNA 的液體活檢特徵對早發性胃癌早期檢測的診斷功效。摘要：早發性胃癌 (EOGC) 是一種致命的惡性腫瘤。它在臨床和分子特徵上與晚發性胃癌 (LOGC) 不同。由於 EOGC 呈上升趨勢，目前的 EOGC 檢測策略在診斷性能方面存在一定的局限性。韦德国际開發了一種用於 EOGC 檢測的液體活檢特徵。韦德国际使用系統發現方法，通過分析來自 EOGC（n=43）、LOGC（n=31）和年齡匹配的非疾病對照（n=37）組織樣本的全基因組轉錄組分析數據。在訓練隊列（n=299）的血液樣本中鑑定出細胞外囊泡來源的長鏈非編碼RNA（EV-lncRNA）特徵，隨後通過qPCR在兩個外部驗證隊列（n=462和n=438）、一個術前/術後隊列（n=66）和一個胃腸道腫瘤隊列（n=225）中進行了確認。開發了一種用於EOGC檢測的三種EV-lncRNA（NALT1、PTENP1和HOTTIP）液體活檢特徵，其受試者工作特徵曲線下面積（AUROC）為0.924（95%CI 0.889至0.953）。該EV-lncRNA特徵在兩個外部驗證隊列中提供了穩健的診斷性能（西安隊列：AUROC，0.911；北京隊列：AUROC，0.9323）。此外，EV-lncRNA 特徵能夠可靠地識別可切除階段的 EOGC 患者（I/II 期），並且在區分早期 EOGC（I 期）和癌前病變方面比傳統的 GC 相關生物標誌物具有更好的診斷性能。術後和其他胃腸道腫瘤血漿樣本中這種生物標誌物的低水平表明其具有 GC 特異性。新開發的 EV-lncRNA 特徵能夠有效地識別處於可切除階段的 EOGC 患者，並且具有更高的精確度，從而改善了原本會錯過治癒性治療窗口的患者的預後。
5.Erythrocyte-derived extracellular vesicles induce endothelial dysfunction through arginase-1 and oxidative stress in type 2 diabetes. 紅細胞衍生的細胞外囊泡通過精氨酸酶-1 和氧化應激誘導 2 型糖尿病中的內皮功能障礙。[J Clin Invest] PMID: 40111409摘要：紅細胞 (RBC) 會誘發 2 型糖尿病(T2D) 患者的內皮功能障礙，但紅細胞與血管溝通的機制尚不清楚。本研究檢驗了以下假設：紅細胞分泌的細胞外囊泡(EV) 可作為 2 型糖尿病患者內皮功能障礙的介質。儘管 2型糖尿病患者紅細胞產生的 EV (T2D RBC-EV) 產量較低，但內皮細胞對它們的吸收量高於健康個體紅細胞產生的 EV (H RBC-EV)。2 型糖尿病 RBC-EV 會損害內皮依賴性舒張，抑制 EV 中的精氨酸酶後，這種影響會減弱。抑制血管精氨酸酶或氧化應激也會減弱 2 型糖尿病 RBC-EV 誘發的內皮功能障礙。在紅細胞衍生的 EV 中檢測到了精氨酸酶-1，與T2D RBC-EV 共培養後，內皮細胞中的精氨酸酶-1 和氧化應激增加。T2D RBC-EV 還增加了 mRNA 沉默後的內皮細胞和內皮細胞精氨酸酶 1 基因敲除小鼠主動脈內皮中的精氨酸酶-1 蛋白。結論是，T2D-RBC 通過增加 EV 的攝取來誘導內皮功能障礙，EV 將精氨酸酶-1 從紅細胞轉移到內皮，從而誘導氧化應激和內皮功能障礙。這些結果為了解 2 型糖尿病中紅細胞介導的內皮損傷機制提供了重要啟示。
6.β-hydroxybutyrate facilitates mitochondrial-derived vesicle biogenesis and improves mitochondrial functions. β-羥基丁酸促進線粒體衍生的囊泡生物合成並改善線粒體功能。[Mol Cell] PMID: 40118051摘要：線粒體動力學和代謝物相互影響。線粒體衍生囊泡 (MDV) 將受損的線粒體成分運輸到溶酶體或細胞外空間。雖然已知許多代謝物會調節線粒體動力學，但它們是否參與 MDV 的生成尚不清楚。在這裏，韦德国际發現酮體的主要成分 β-羥基丁酸 (BHB) 通過促進 MDV 的生物合成來改善線粒體功能。從機制上講，BHB 驅動分選 nexin-9 (SNX9) 的特定賴氨酸 β-羥基丁酰化 (Kbhb)，SNX9是 MDV 生物合成的關鍵調節因子。Kbhb 增加了 SNX9 與線粒體內膜 (IMM)/基質蛋白的相互作用並促進了 IMM/基質 MDV 的形成。SNX9 Kbhb 不僅對維持細胞內的線粒體穩態至關重要，而且還能保護小鼠免受酒精引起的肝損傷。總之，韦德国际的研究揭示了代謝物通過直接參與關鍵蛋白質機制的翻譯後修飾來影響 MDV 形成的事實，並為理解代謝物如何調節線粒體功能建立了一個框架。
7.Clade-specific extracellular vesicles from Akkermansia muciniphila mediate competitive colonization via direct inhibition and immune stimulation. 來自 Akkermansia muciniphila 的分支特異性細胞外囊泡通過直接抑制和免疫刺激介導競爭性定植。[Nat Commun] PMID: 40108178摘要：Akkermansia muciniphila 是下一代益生菌的有希望的候選者，它表現出顯著的基因組多樣性，分為幾個不同的進化枝（AmI 至 AmIV）。值得注意的是，單個 Akkermansia 進化枝往往在單個宿主中佔主導地位，不同進化枝同時出現的情況很少見。驅動這種進化枝特異性排斥的機制仍不清楚。在這裏，韦德国际表明來自 AmII 進化枝的細胞外囊泡 (EV) 抑制了進化枝 I (AmI) 的生長，從而賦予 AmII 競爭優勢。此外，韦德国际觀察到進化枝特異性免疫球蛋白 A (IgA) 反應，其中由來自 AmII 的 EV 誘導的 AmII 進化枝特異性IgA 促進了生態位佔據和 AmI 的競爭性排斥。這些發現為A. muciniphila 進化枝的競爭動態提供了見解，並表明可以通過考慮單個宿主中 A. muciniphila 進化枝的組成來優化未來個性化的微生物組干預措施。
8.Toward Identification of Markers for Brain-Derived Extracellular Vesicles in Cerebrospinal Fluid: A Large-Scale, Unbiased Analysis Using Proximity Extension Assays. 識別腦脊液中腦源性細胞外囊泡的標記物：使用鄰近延伸分析進行大規模、無偏分析。[J Extracell Vesicles] PMID: 40098346摘要：在生物體液中捕獲的細胞外囊泡 (EV) 為液體活檢開闢了新領域。為了富集來自特定細胞類型或腫瘤的囊泡，科學家利用針對目標細胞類型相對獨特的跨膜蛋白的抗體。然而，最近的證據對基本假設提出了質疑，即在生物體液中測量的所有跨膜蛋白實際上都與 EV 相關。為了確定腦源性 EV 免疫捕獲和貨物蛋白的候選標記以驗證 EV 的細胞來源，韦德国际進行了無偏 Olink 篩選，在尺寸排阻色譜法後測量了腦脊液中的 5416 種獨特蛋白質。韦德国际確定了表現出清晰 EV 分餾模式的蛋白質，並創建了一個可搜索的候選 EV 相關標記數據集 - 這兩種蛋白質都是大腦內細胞類型特異性的，以及在多種細胞類型中發現的可用作一般 EV 標記的蛋白質。韦德国际進一步實施了 DeepTMHMM 深度學習模型來區分預測的細胞質、跨膜和外部蛋白質，並發現有趣的是，根據韦德国际嚴格的標準，只有 10% 的預測跨膜蛋白具有清晰的 EV 分餾模式。該數據集進一步強調了在下游使用目標進行 EV 分析之前使用尺寸排阻色譜法等方法驗證候選蛋白質的 EV 關聯的重要性。
9.Endocrine-exocrine miR-503-322 drives aging-associated pancreatitis via targeting MKNK1 in acinar cells. 內分泌-外分泌 miR-503-322 通過靶向腺泡細胞中的 MKNK1 來驅動與衰老相關的胰腺炎。[Nat Commun] PMID: 40097383摘要：衰老是慢性胰腺炎的危險因素，也是其急性發作的嚴重程度決定因素，但其根本原因尚不清楚。本文中，韦德国际證明內分泌性胰腺的衰老 β 細胞決定了慢性和急性胰腺炎的發病和嚴重程度。在生理衰老過程中，衰老的 β 細胞會增加 miR-503-322 的表達，miR-503-322 以小細胞外囊泡形式分泌進入外分泌腺泡細胞，在衰老相關的胰腺炎中發揮因果和可逆的作用。從機制上講，miR-503-322 靶向 MKNK1 以抑制腺泡細胞分泌，從而導致自身消化並抑制增殖，從而修復外分泌性胰腺損傷。在老年人群中，血清 miR-503 濃度與澱粉酶呈負相關，由於老年胰腺中 miR-503 增加和 MKNK1 減少，易患慢性胰腺炎。韦德国际的研究結果強調了miR-503-322-MKNK1 軸介導內分泌-外分泌調節通路，尤其是在老年小鼠和人類中。調節該軸可能為與衰老相關的胰腺炎提供潛在的預防和治療策略。
10.Unravelling the Significance of Extracellular Vesicle-Associated DNA in Cancer Biology and Its Potential Clinical Applications. 揭示細胞外囊泡相關DNA在癌症生物學中的意義及其潛在的臨床應用。[J Extracell Vesicles] PMID: 40091452摘要：細胞外囊泡 (EV) 在細胞間通訊中起着關鍵作用，由於其潛在的臨床應用而引起了廣泛關注。然而，關於EV 相關 DNA (EV-DNA) 的生物學仍有許多需要了解的地方。EV-DNA 由正常細胞和惡性細胞主動釋放，由結構各異的不同片段組成。由於 EV-DNA涵蓋了其來源細胞的整個基因組，因此它作為癌症診斷和監測的生物標記物仍然很有吸引力。此外，EV-DNA 傳遞可以通過干擾細胞質 DNA 傳感器通路來改變受體細胞的功能。本綜述探討了 EV-DNA 的生物學和意義，包括其拓撲結構和片段組學特徵、與 EV 的關聯方式、包裝機制和潛在功能。它還強調了囊泡 DNA 在識別癌症遺傳和表觀遺傳變化方面的特異性。此外，它深入研究了 EV-DNA 對細胞行為的影響及其作為癌症治療靶點的潛在用途。該評論討論了對EV-DNA 生物學的新見解，並提供了解決未來 EV-DNA 研究挑戰和問題的觀點和替代方案。
11.Quantitative Lipid Analysis of Extracellular Vesicle Preparations: A Perspective. [J Extracell Vesicles] PMID: 40091364摘要：需要通過質譜法進行定量脂質組學分析，以測定細胞外囊泡 (EV) 的脂質含量。此類方法可以提供有關脂質總量、脂質種類組成、EV 樣品純度以及 EV 細胞來源的信息。然而，進行脂質分析時存在許多陷阱。因此，任何非專業人士都應與脂質組學專家合作。除了許多提供脂質分析建議的優秀評論文章外，韦德国际還推薦國際脂質組學協會下屬興趣小組脂質組學標準倡議發佈的信息和指南。
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【關於韦德国际生物】
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