本周hzangs在最新文獻中選取了12篇分享給大家，第1篇文章介紹了一種基於自擴增和CRISPR輔助的EV mRNA分析策略；第2篇文章介紹了重複RNA序列對胰腺癌細胞可塑性的影響及細胞外囊泡在重複RNA功能調控中發揮的作用；第5篇文章介紹了神經幹細胞來源細胞外囊泡對腦溢血後神經元細胞的保護作用；第7篇文章報道了植物韌皮部浸出液中存在細胞外囊泡並且細胞外囊泡的數量與昆蟲入侵有關；第10篇文章綜述了现在線粒體相關細胞外囊泡的研究進。

1.Amplifying mutational profiling of extracellular vesicle mRNA with SCOPE. 

使用 SCOPE 擴增細胞外囊泡 mRNA 的突變分析。

[Nat Biotechnol] PMID: 39375445

摘要：對液體活檢中細胞外囊泡 (EV) 中發現的信使 RNA (mRNA) 進行測序可以给予臨床信息，例如體細胞突變、耐藥性特徵和腫瘤復發。儘管如此，由於 EV mRNA 在液體活檢中的豐度較低，因此仍未得到充分利用，需要大量樣本或專門的分析技術。在這裏，韦德国际介紹了自擴增和 CRISPR 輔助操作以分析 EV (SCOPE)，這是一個用於 EV mRNA 檢測的平台。SCOPE 利用 CRISPR 介導的 Cas13 對目標 RNA 的識別來啟動複製和信號擴增，實現亞阿摩爾檢測限，同時保持單核苷酸解像度。作為概念驗證，韦德国际設計了針對 KRAS、BRAF、EGFR 和 IDH1 基因中關鍵突變的探針，優化了單罐檢測方案，並實施了用於多樣本檢測的自動化設備。韦德国际驗證了 SCOPE 在動物模型中檢測早期肺癌的能力，監測了結直腸癌患者和分層膠質母細胞瘤患者的腫瘤突變負荷。SCOPE 可以加快讀數速度，擴大 EV 在精準腫瘤學中的臨床應用。

2.Disruption of cellular plasticity by repeat RNAs in human pancreatic cancer. 

人類胰腺癌中的重複 RNA 破壞了細胞可塑性。

[Cell] PMID: 39383862

摘要：胰腺導管腺癌 (PDAC) 中重複 RNA 的異常表達模擬病毒樣反應，對腫瘤細胞狀態和周圍微環境的反應有影響。為了更好地分析人類 PDAC 中重複 RNA 的關係，韦德国际在 46 個原發性腫瘤中以單細胞解像度進行了空間分子成像，揭示了高重複 RNA 表達與 PDAC 細胞上皮狀態改變以及癌症相關成纖維細胞 (CAF) 中肌成纖維細胞表型的相關性。顺利获得給藥細胞外囊泡 (EV) 和 PDAC 和 CAF 細胞培養模型的單個重複 RNA 觀察到這種細胞身份的喪失，這表明這些病毒樣元素存在細胞間相互通訊。PDAC 和 CAF 反應的差異是由顺利获得干擾素調節因子 3 (IRF3) 的不同先天免疫信號驅動的。細胞環境特異性病毒樣對重複 RNA 的反應為調節 PDAC 微環境中不同細胞類型的細胞可塑性给予了一種機制。

3.The emerging role of bacterial extracellular vesicles in human cancers.

細菌細胞外囊泡在人類癌症中發揮的新興作用。

[J Extracell Vesicles] PMID: 39377479

摘要：細菌細胞外囊泡 (BEV) 已成為細菌和宿主之間的關鍵介質。除了作為宿主體內平衡的關鍵參與者之外，它們最近還與癌症等疾病病理有關。因此，BEV 的研究代表了一個有趣且快速开展的領域，具有巨大的轉化潛力。在這篇綜述中，韦德国际簡要介紹了 BEV 特徵、貨物和生物發生的基礎知識。韦德国际着重總結了當前不同癌症類型中 BEV 之間的關係，說明了它們在腫瘤發生、治療反應和患者生存中的作用。韦德国际進一步討論了 BEV 的固有優勢，例如穩定性、豐度和特定的貨物概況，這些優勢使它們成為非侵入性診斷和預後方法的有吸引力的候選者。該綜述還探討了 BEV 作為癌症治療策略的潛力，考慮到它們能夠遞送治療劑、調節腫瘤微環境 (TME) 並引發免疫調節反應。分析 BEV 的臨床意義可能導致開發更有針對性和個性化的治療策略。這篇全面的評論評估了BEV 的最新進展，並提出了問題，以鼓勵在這一新興領域進行進一步研究，充分利用 BEV 在抗癌臨床應用中的優勢。

4.Reduced microRNA-744 expression in mast cell-derived exosomes triggers epithelial cell ferroptosis in acute respiratory distress syndrome. 

肥大細胞來源的外泌體中 microRNA-744 表達降低會引發急性呼吸窘迫綜合徵中的上皮細胞鐵死亡。

[Redox Biol] PMID: 39378613

摘要：急性呼吸窘迫綜合徵 (ARDS) 是一種以免疫相關上皮細胞損傷為特徵的嚴重疾病；然而，其潛在機制仍然難以捉摸。本研究調查了肥大細胞衍生外泌體中微小 RNA (miRNA) 表達變化對人支氣管上皮 (HBE) 細胞和受到脂多糖攻擊的細胞和小鼠模型中的 ARDS 开展的影響。脂多糖處理的肥大細胞衍生外泌體降低了谷胱甘肽過氧化物酶 4 (GPX4) 的表達，並增加了 HBE 細胞中的長鏈酰基輔酶A 合成酶 4 (ACSL4)、15-脂氧合酶 (ALOX15) 和炎症介質的水平。miRNA 測序顯示肥大細胞衍生的外泌體 miR-744 水平降低，這與 ACSL4、ALOX15 和 GPX4 表達的調節有關。外泌體 miR-744 表達的下調降低了 miR-744 水平並促進了 HBE 細胞中的鐵死亡，而 miR-744 的實驗性上調則逆轉了這些不利影響。miR-744 的下調誘導了 HBE 細胞中鐵死亡和炎症標誌物的表達，並促進了 LPS 刺激小鼠的肺部鐵死亡、炎症和損傷。在體內，用 ACSL4、ALOX15 和 GPX4 抑制劑治療可減輕這些影響，實驗性 miR-744 表達可挽救 HBE 細胞和小鼠肺中脂多糖誘導的變化。值得注意的是，ARDS 患者血漿和外泌體中的 miR-744 水平降低。韦德国际得出結論，肥大細胞衍生的外泌體 miR-744 水平降低會引發上皮細胞鐵死亡，促進 ARDS 中的肺部炎症和損傷。這項研究為 ARDS 相關的开展和持續性肺損傷给予了新的機制見解，並強調了潛在的治療策略。

5.Extracellular vesicles from neural stem cells safeguard neurons in intracerebral hemorrhage by suppressing reactive astrocyte neurotoxicity. 

神經幹細胞的細胞外囊泡顺利获得抑制反應性星形膠質細胞神經毒性來保護腦出血中的神經元。

[Cell Rep] PMID: 39395173

摘要：源自幹細胞的細胞外囊泡 (EV) 已顯示出對各種疾病的治療潛力，但它們在治療神經系統疾病方面的應用仍然有限。在本研究中，韦德国际觀察到小鼠和腦出血 (ICH) 患者中反應性星形膠質細胞和脂肪凋亡途徑的神經毒性激活，並發現源自神經幹細胞的 EV (EVs-NSC) 可以抑制這種激活。使用功能喪失和功能取得方法，韦德国际確定干擾素-β (IFNβ) 是星形膠質細胞神經毒性激活的關鍵調節因子。此外，韦德国际證明 EVs-NSC 內的微小 RNA (miRNA) miR-124-3p 分別顺利获得 miRNA 編碼序列 (CDS) 和miRNA-3' UTR 結合機制降解 IFNβ mRNA 並抑制 ELOVL1 表達。這種雙重作用可能顺利获得降低飽和脂質分泌來降低星形膠質細胞的神經毒性。這些機制使 EVs-NSC 或 miR-124-3p 過表達能夠抑制星形膠質細胞神經毒性、減少神經損傷並促進 ICH 模型中的恢復，為顺利获得靶向神經毒性反應性星形膠質細胞治療神經系統疾病给予策略。

6.Neuronal exosomes transport an miRISC cargo to preserve stem cell integrity during energy stress. 

神經元外泌體運輸 miRISC 貨物以在能量壓力期間保持幹細胞完整性。

[Cell Rep] PMID: 39392750

摘要：在營養匱乏期間，許多動物會經歷生殖系靜止期以保持生殖能力，而神經元通常是這種適應所必需的。韦德国际在此表明，飢餓會導致神經元微小 RNA (miRNA)/Argonaute 負載的外泌體釋放，這是在血清素能神經元內AMP 激酶調節的運輸變化之後發生的。這種神經元到生殖系的通訊獨立於經典的神經傳遞，而是依賴於攜帶促靜止小RNA 貨物的內體衍生囊泡來修改生殖系基因表達。使用 miRNA 活性傳感器，韦德国际表明神經元表達的 miRNA 可以以外泌體依賴的方式抑制生殖系 mRNA 靶標的表達。韦德国际的研究結果表明，適應性神經元反應如何顺利获得重定向細胞內運輸來釋放神經元外泌體，從而遠距離改變基因表達，其中特定的 miRNA 貨物能夠追蹤到適當的目的地。

7.Phloem sap from melon plants contains extracellular vesicles that carry active proteasomes which increase in response to aphid infestation.

甜瓜植株的韌皮部汁液含有攜帶活性蛋白酶體的細胞外囊泡，而蛋白酶體的數量會因蚜蟲侵染而增加。

[J Extracell Vesicles] PMID: 39385682

摘要：高等植物的形態發生需要顺利获得維管組織（木質部和韌皮部）與遠處器官進行通訊。大量研究表明，韌皮部也是信號分子的分佈途徑，觀察到由汁液轉移的不同大分子（包括核酸和蛋白質）在應激情況下發生變化。有人提出細胞外囊泡 (EV) 參與了這種通訊，儘管人們對其作用知之甚少。事實上，在過去十年中，EV 在植物中的存在引發了一場巨大的爭議，主要關注點在於它們的來源、分離方法，甚至植物納米囊泡的適當命名。顺利获得莖切開收集了無蚜蟲或受棉蚜感染的甜瓜植物的韌皮部汁液滲出物。在汁液濃縮（Amicon）後，顺利获得尺寸排阻色譜法分離韌皮部 EV（PhlEV）。使用納米粒子跟蹤分析、透射電子顯微鏡和蛋白質組學分析對 PhlEV 進行了表徵。在這裏，韦德国际確認了體內韌皮部汁液中存在 EV，並檢測到 PhlEV 在昆蟲進食後顆粒/蛋白質比率和成分的變化，揭示了其貨物中存在典型的防禦蛋白以及蛋白酶體複合物的成分。受侵染植物的 PhlEV 顯示出較低的顆粒/蛋白質比率，蛋白水解活性幾乎是無蚜蟲植物的 PhlEV 的兩倍。在這兩種情況下，蛋白酶體抑制劑 MG132 都以劑量依賴性方式抑制了這種活性。韦德国际的結果表明，植物可能使用這種機制來準備接受傳染性病原體，並開啟了真核生物進化保守的防禦病原體/壓力機制的可能性。

8.Dopey-dependent regulation of extracellular vesicles maintains neuronal morphology.

Dopey 依賴的細胞外囊泡調節維持神經元的形態。

[Curr Biol] PMID: 39378880

摘要：成熟的神經元在成年期會長時間保持其獨特的形態。與發育神經突生長、軸突引導和靶標選擇相比，人們對維持成熟神經元形態的機制知之甚少。秀麗隱杆線蟲 dip-2（保守的脂質代謝調節劑 Dip2 家族的成員）的功能喪失導致成年神經突逐漸過度生長。韦德国际發現 dip-2 突變體與 sax-2（果蠅Furry 和哺乳動物 FRY 的秀麗隱杆線蟲直系同源物）表現出特定的遺傳相互作用。dip-2 和 sax-2 的共同缺失導致無法維持神經元形態和神經元細胞外囊泡 (EV) 釋放增加。顺利获得篩選 dip-2(0) sax-2(0) 雙突變體缺陷的抑制因子，韦德国际發現保守的 Dopey 家族蛋白 PAD-1 及其相關磷脂翻轉酶 TAT-5/ATP9A 中的功能取得 (gf) 突變可恢復 dip-2(0) sax-2(0) 雙突變體的正常神經元形態和正常水平的 EV 釋放。神經元特異性敲低表明 PAD-1(gf) 可以在神經元中自主發揮作用。PAD-1(gf) 在卵母細胞中與質膜的結合增加，並抑制多種細胞類型中的 EV 釋放。韦德国际的研究結果揭示了 DIP-2、SAX-2、PAD-1 和 TAT-5 的新型功能網絡，該網絡可維持神經元形態並調節 EV 釋放。

9.Small RNAs in plasma extracellular vesicles define biomarkers of premanifest changes in Huntington's disease. 

血漿細胞外囊泡中的小RNA定義了亨廷頓氏病前期變化的生物標誌物。

[J Extracell Vesicles] PMID: 39377487

摘要：儘管對亨廷頓病 (HD) 的分析取得了進展，但仍需要分子生物標記物來對功能衰退之前的疾病臨床前階段的突變攜帶者進行分類。小 RNA (sRNA) 是一種有前途的生物標記物來源，因為它們的表達水平對病理生物學過程高度敏感。在這裏，使用優化的血漿細胞外囊泡 (EV) 純化方法和詳盡的 sRNA 測序數據分析流程，韦德国际表明 EV-sRNA 在突變攜帶者的早期下調，並且這種失調與表現前的認知表現有關。七種候選sRNA（tRF-Glu-CTC、tRF-Gly-GCC、miR-451a、miR-21-5p、miR-26a-5p、miR-27a-3p 和 let7a-5p）在其他受試者中得到驗證，顯示在表現前階段具有顯着的診斷準確性。其中，縱向研究中，miR-21-5p 隨時間顯著下降；miR-21-5p 和 miR-26a-5p 水平與症狀前人群的認知變化相關。總之，本研究結果表明，血漿中失調的 EV-sRNA 定義了突變攜帶者的早期生物特徵，特定物種突出了症狀前階段發生的進展和認知變化。

10.Mitochondrial Extracellular Vesicles (mitoEVs): Emerging mediators of cell-to-cell communication in health, aging and age-related diseases. 

線粒體細胞外囊泡（mitoEVs）：健康、衰老和與年齡相關的疾病中細胞間通訊的新興介質。

[Ageing Res Rev] PMID: 39369800

摘要：線粒體是代謝和信號中樞，整合大量相互關聯的過程以維持細胞穩態。它們也是炎症和細胞死亡的休眠介質，隨着衰老，影響線粒體的損傷逐漸積累，導致與年齡相關的疾病的表現。除了協調多種細胞內功能外，線粒體還在不同的生理和壓力條件下介導細胞間和器官間的串擾。為了完成這項任務，線粒體信號傳導已經進化出獨特而複雜的常規和非常規水平/垂直線粒體轉移途徑。在這方面，人們對細胞外囊泡（EVs）（例如外泌體和微囊泡）響應內部和外部線索將選定的線粒體貨物運送到靶細胞的能力產生了極大的興趣。在過去的幾年中，線粒體 EV（mitoEV）領域呈指數級增長，揭示了與不斷擴展的線粒體功能相關的這些結構的意外異質性，儘管其潛在機制的全部範圍還遠未闡明。因此，新興的 EV 子集包括外泌體、遷移體、線粒體、線粒體囊泡和線粒體溶酶體，它們可以局部或長距離作用以恢複線粒體的穩態和細胞功能，或擴增疾病。本綜述全面概述了韦德国际现在對不同生理和病理條件下 MitoEV 的生物學和運輸的理解。此外，還特別討論了 mitoEV 在衰老以及不同與年齡相關的疾病的發生和开展中的作用。

11.Hijacking host extracellular vesicle machinery by hepatotropic viruses: current understandings and future prospects.

肝嗜性病毒劫持宿主細胞外囊泡機制：现在的理解和未來的前景。

[J Biomed Sci] PMID: 39369194

摘要：最近，在探索細胞外囊泡 (EV) 在病毒傳播和複製中的作用方面取得的研究進展，闡明了嗜肝病毒，例如甲型肝炎(HAV)、乙型肝炎 (HBV)、丙型肝炎 (HCV)、丁型肝炎 (HDV) 和戊型肝炎 (HEV)。雖然之前的研究已經揭示了這些病毒利用細胞 EV 途徑進行複製和傳播的能力，但大多數研究都集中在外泌體途徑的影響上。隨着對 EV 的分析不斷加深，人們根據大小和生物途徑將其分為四種主要亞型，包括外泌體、微泡、大癌體和凋亡小體。然而，在總結最新發現和概述嗜肝病毒 EV 研究未來前景的綜合評論方面仍然存在明顯的差距。本綜述旨在鞏固對嗜肝病毒利用的EV 途徑的見解，為該領域未來的研究方向给予指導。顺利获得分析多種嗜肝病毒相關的EVs及其在生產性病毒感染期間在細胞通訊中的作用，本綜述可能為針對性治療方法和制定對抗惡性嗜肝病毒感染及相關肝癌發病率的策略给予有價值的見解。

12.Extracellular Vesicles from Nanomedicine-Trained Intestinal Microbiota Substitute for Fecal Microbiota Transplant in Treating Ulcerative Colitis. 

納米醫學訓練的腸道微生物群的細胞外囊泡替代糞便微生物群移植治療潰瘍性結腸炎。

[Adv Mater] PMID: 39073205

摘要：與糞便微生物移植 (FMT) 相關的生物安全問題限制了其在治療潰瘍性結腸炎 (UC) 中的臨床應用。腸道微生物分泌豐富的細胞外囊泡 (Gm-EVs)，這些囊泡在細菌與細菌以及細菌與宿主之間的通訊中起着關鍵作用。在此，使用茶葉脂質/普盧蘭尼克 F127 包覆的薑黃素納米晶體 (CN@Lp127s) 來訓練腸道微生物，這些納米晶體可以在顺利获得胃腸道的過程中保持穩定性。與 FMT 相比，來自健康小鼠的 Gm-EVs 顺利获得減少結腸炎症反應、恢復結腸屏障功能和重新平衡腸道微生物群，顯著改善了對 UC 的治療效果。令人驚訝的是，與接受健康小鼠 FMT、健康小鼠 Gm-EV 和 CN@Lp127 訓練的健康小鼠 FMT 的組相比，從 CN@Lp127 訓練的健康小鼠身上取得的 Gm-EV 對 UC 表現出更好的治療效果。口服 CN@Lp127 訓練的健康小鼠的 Gm-EV 不僅可以減輕結腸炎症、促進粘膜修復和調節腸道菌群，還可以調節嘌呤代謝以降低尿酸水平，從而顯著改善 UC。這項研究證明了從納米藥物訓練的腸道菌群中提取的 Gm-EV 在調節結腸的免疫微環境、菌群和嘌呤代謝方面的 UC 治療效果。這些 EV 為替代FMT 作為 UC 治療方法给予了替代平台。

今天的整理就到這裏。希望大家可以有所收穫。大家下周見！