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JEV丨一些研究中報道的EV功能可能是由於轉染試劑的污染!

JEV丨一些研究中報道的EV功能可能是由於轉染試劑的污染!

  • 分類:新聞
  • 作者:韦德国际生物
  • 來源:韦德国际生物
  • 發佈時間:2022-10-21
  • 訪問量:282

【概要描述】細胞外囊泡(EV)是細胞通訊和生理的重要介質。顺利获得瞬時轉染質粒DNA到靶細胞中,可以產生出特定蛋白質或核酸修飾的EV。然而,DNA轉染試劑複合物(DTC)的大小與EV大致相同,傳統的超離純化可能無法分離這兩種物質,並且DTC產生的活性可能會與EV活性相混淆。

JEV丨一些研究中報道的EV功能可能是由於轉染試劑的污染!

【概要描述】細胞外囊泡(EV)是細胞通訊和生理的重要介質。顺利获得瞬時轉染質粒DNA到靶細胞中,可以產生出特定蛋白質或核酸修飾的EV。然而,DNA轉染試劑複合物(DTC)的大小與EV大致相同,傳統的超離純化可能無法分離這兩種物質,並且DTC產生的活性可能會與EV活性相混淆。

  • 分類:新聞
  • 作者:韦德国际生物
  • 來源:韦德国际生物
  • 發佈時間:2022-10-21
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以下文章來源於外泌體之家(公眾號)

細胞外囊泡(EV)是細胞通訊和生理的重要介質。顺利获得瞬時轉染質粒DNA到靶細胞中,可以產生出特定蛋白質或核酸修飾的EV。然而,DNA轉染試劑複合物(DTC)的大小與EV大致相同,傳統的超離純化可能無法分離這兩種物質,並且DTC產生的活性可能會與EV活性相混淆。來自Codiak BioSciences公司的研究人員發現,差速超速離心(一種常用的EV分離程序)不能將EV與瞬時轉染細胞的細胞培養上清液中的DTC分離。因此,一些研究報告的EV活性可能是由於轉染試劑的污染,而不是EV介導的貨物輸送,這表明了對EV樣品進行嚴格純化和表徵的必要性。相關研究以「Transfection reagent artefact likely accounts for some reports of extracellular vesicle function」為題於10月10日在J Extracell Vesicles雜誌上發表。

 

圖:Cre轉染後細胞分泌的超速離心顆粒(UCP)中存在的Cre活性不全部來源於EV。(A)將從轉染了Expifectamine的細胞中分離出的UCP分離為四個組分(F1-4)。(B)用抗Cre抗體和EV標記物CD9和CD81對UCP和密度梯度組分進行Western blot分析。(C)蛋白質印跡密度法定量Cre蛋白(i)。(ii)用50μM氯喹和UCP或F1-4處理3天後,顺利获得流式細胞儀分析GFP+報告細胞的定量。(D-F)瓊脂糖凝膠用DNA染料染色,顯示樣本的PCR擴增。(G)用50μM氯喹和UCP或F1-4處理的GFP+報告細胞的定量。對於無細胞條件,在Cre質粒瞬時轉染中沒有細胞的情況下,進行模擬轉染。

細胞外囊泡(EV)是由迄今為止被檢測的所有細胞釋放,與多種生理和病理過程有關。EV可以顺利获得EV表面分子(蛋白質、聚糖或脂類)與受體細胞表面受體的相互作用,或顺利获得向受體細胞輸送貨物來介導其對受體細胞的影響。雖然EV貨物運輸的確切機制尚不清楚,但利用EV自帶的天然通信網絡對於開發EV療法具有特別重要的意義。

近年來,許多研究已經證明EV能夠運送多種貨物,包括DNA、RNA和蛋白質。然而,不同研究中的EV傳送效率和程度差異很大,可能是由於EV來源、生產方法、分離方法和所用報告系統的不同。特別是,關於EV傳遞核苷酸能力的報道差異很大,一些報道稱EV介導的RNA敲除功能很強大,而另一些報道稱沒有可識別的功能傳遞。類似地,報道的蛋白質傳遞效率範圍不確定,從高水平Cre到低水平傳遞Cre、Cas9和薑黃素都有。在許多情況下,研究報告的EV的作用不大,這可能需要更靈敏的報告系統來檢測。然而,這些報告系統的敏感性可能使其容易受到人為因素的影響,重要的是要確保包括適當的控制,以排除非EV來源的物質的干擾。

最近有研究報道稱,顺利获得裝載Cre重組酶的EV用於編輯一個報告細胞系,並且在增強DNA轉染試劑複合物的內體途徑逃逸藥物(如氯喹)的存在下,這種基因編輯活性顯著增加。研究人員顺利获得以下相同的程序複製了這一發現:用EV靶向的Cre去轉染細胞,然後顺利获得差速超速離心純化該細胞分泌的EV,並用再重懸的超速離心顆粒(UCP)處理報告細胞。雖然研究人員能夠檢測到含有EV的UCP樣本中的Cre活性,但也觀察到Cre蛋白水平與Cre活性水平並不相關,這與之前其他課題組觀察到的情況類似。

因此研究人員認為,當使用瞬時轉染並進行標準的EV純化時,EV在報告細胞的基因編輯中實際上是可有可無的;相反,Cre活性是由於DNA轉染試劑複合物(DTC)與UCP中的EV共同純化出來而造成的。研究數據證明,EV靶向的Cre重組酶的生物活性是由於質粒DNA的污染,而不是EV介導的Cre蛋白傳遞。儘管DTC在電荷和密度方面與EV在生物物理學上有所不同,但它們在大小上相似,因此某些純化方法(如差速超速離心)不太可能分離這兩種類型。通常採取的從EV樣本中去除質粒DNA的步驟是介質交換和核酸酶處理,但在這種情形下是無效的。由於這些細胞分析中質粒DNA的有害性質,因此一些關於EV功能的研究可能是DTC污染樣本產生的功能。EV和DTC可以顺利获得密度梯度超速離心分離,這突出了在使用EV生產時,如果顺利获得瞬時轉染來檢測EV功能時,一定要確保消除DTC。

 

參考文獻: Transfection reagent artefact likely accounts for some reports of extracellular vesicle function. J Extracell Vesicles. 2022;11(10):e12253.



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